Эволюция живых существ может быть понята только в контексте геологического времени.
В неживых системах при экзотермических реакциях расщепления образуются молекулы меньшего размера и освобождается значительное количество тепла. В живых системах образуются макроэргические фосфатные связи, молекулы меньшего размера и выделяется поразительно мало тепла. В самом деле, одна из важнейших особенностей энергетических механизмов в живых системах — тесное сопряжение реакций, связанных с освобождением и запасанием энергии, благодаря чему энергия может быть сохранена для последующего использования. Разумеется, первичным источником энергии для всех современных организмов служит солнечный свет, энергия которого улавливается фотосинтезирующими организмами и в конечном счете запасается в форме фосфатных связей в результате фотофосфорилирования — процесса, сходного с описанным выше процессом, — или же в молекулах углеводов, синтезируемых также при участии процессов фосфорилирования. Многие важные ферменты фотосинтеза и биологического окисления представляют собой окрашенные комплексы, содержащие ионы металлов и органические соединения, называемые порфиринами. Кальвин построил схему, показывающую, как могли бы возникнуть такого рода важные для жизни вещества в процессе химического отбора, связанного с автокатализом. В этом ряду постепенно усложняющихся молекул образующиеся продукты служат катализаторами для последующих этапов синтеза. Поскольку порфирины используются многими нефотосинтезирующими организмами, Кальвин предполагает, что небольшие изменения случайного характера в порфиринах могли привести в конце концов к возникновению хлорофилла и к «изобретению» фотосинтеза. Гранин, кроме того, полагает, что все окрашенные соединения в ряду, ведущем к хлорофиллу, возможно, выполняли ту же Функцию, что и хлорофилл. На ранних этапах химической эволюции ионы металлов, входящие в состав минералов, могли катализировать те же реакции, которые они катализируют сейчас, входя в состав металлсодержащих ферментов.