Эволюция живых существ может быть понята только в контексте геологического времени.
Цитологический механизм кроссинговера с точностью не известен. Предполагается, что в профазе первого деления мейоза во время синапсиса, когда хромосомы обвивают друг друга, хроматиды разрываются и затем концы их фрагментов вновь соединяются. Если соединятся несестринские хроматиды, произойдет кроссинговер. Кроссинговер происходит с различной частотой в разных участках хромосомы. Вблизи от центромеры и у самых концов хромосом кроссинговера не бывает или он наблюдается редко. Поблизости от блоков гетерохроматинового материала частота кроссинговера также снижена. У некоторых организмов кроссинговер обычно происходит только. в определенных участках хромосом; у других он, по-видимому, встречается довольно равномерно по всей длине плеча хромосомы. Вероятно, такие различия, по крайней мере отчасти, зависят от количества гетерохроматина и его распределения. В некоторых случаях кроссинговер бывает полностью подавлен; это наблюдается, например, у самцов дрозофилы и у самок тутового шелкопряда . Кроме того, перекрест в одном участке хромосомы снижает вероятность другого перекреста в смежном участке. Степень этой так называемой интерференции можно оценить, изучая сцепление; можно показать, что она различна для разных участков одной хромосомы и для разных хромосом. Вероятно, интерференция также обусловлена структурными причинами.
Если два фактора расположены в хромосоме на достаточном расстоянии друг от друга, между ними может произойти более одного перекреста. При двойном кроссинговере рекомбинационный эффект зависит от того, какие хроматиды в нем участвуют : если в обоих перекрестах участвуют одни и те же две хроматиды из четырех, составляющих бивалент, то это событие нельзя обнаружить. Если же второй кроссинго - вер происходит между двумя хроматидами, не участвовавшими в первом перекресте, то в каждой хроматиде обнаруживается только один перекрест. Эти два случая можно назвать Двуххро - матидным обменом и Четыреххроматидным обменом. Треххро - матидный обмен приводит к образованию одной некроссоверной хроматиды и трех хроматид с одиночными перекрестами. Вообще хромосомы с четным числом перекрестов или вовсе без перекрестов, образовавшиеся при множественном кроссинговере между факторами, будут проявляться как хромосомы родительского типа.